| Família | Nome Científico | Nome Vulgar | Categoria |
| Palmae | Acanthococos emensis Toledo | | Rara |
| Bromeliaceae | Aechmea apocalyptica Reitz | | Rara |
| Bromeliaceae | Aechmea blumenavii Reitz | gravatá, monjola, bromélia | Rara |
| Bromeliaceae | Aechmea kleinii Reitz | gravatá, monjola, bromélia | Rara |
| Bromeliaceae | Aechmea pimenti-velosii Reitz | gravatá, monjola, bromélia | rara |
| Lauraceae | Aniba roseodora Ducke | pau-de-rosa | Em perigo |
| Araucariaceae | Araucaria angustifolia (Bertol)O. Kuntese | pinheiro-do-paraná | Vulnerável |
| Compositae | Aspilia grasielae Santos | | Indeterminada |
| Compositae | Aspilia paraensis (Huber) Santos | | Rara |
| Compositae | Aspilia pohlii Backer | | Indeterminada |
| Compositae | Aspilia procumbens Backer | | Rara |
| Anacardiaceae | Astronium fraxinifolium Schott | gonçalo-alves | Vulnerável |
| Anacardiaceae | Astronium urundeuva (Fr.All.) Engl | aroeira-do-sertão, aroeira-legítima | Vulnerável |
| Leguminosae | Bauhinia smilacina (Schott) Steudel | cipó-escada-de-macaco | Vulnerável |
| Lecythidaceae | Bertholletia excelsa HBK | castanheira, castanheira-do-brasil | Vulnerável |
| Bromeliaceae | Billbergia alfonsi-joannis Reitz | poço-de-jacó, gravatá,.monjola,.bromélia | Em perigo |
| Leguminosae | Bowdickia nitida Spruce ex Benth | sucupira, sucupira-da-mata, sucupira-verdadeira | Vulnerável |
| Moraceae | Brosimum glaucum Taubert | | Rara |
| Moraceae | Brosimum glazioui Taubert | marmelinho | Rara |
| Sapotaceae | Bumelia obtusifolia Roem et Schult. var. excelsa (DC) Mig | quixabeira | Vulnerável |
| Leguminosae | Caesalpinia echinata Lam | pau-Brasil, pau-pernambuco, ibirapitanga | Em perigo |
| Lecythidaceae | Cariniana ianeirensis Kunth | jequitibá | Rara |
| Orchidaceae | Cattleya schilleriana Reichback | | Em perigo |
| Zingiberaceae | Costus cuspidatus (Nees et Martins). Maas | | Rara |
| Zingiberaceae | Costus fragilis Maas | | Rara |
| Zingiberaceae | Costus fusiformis Maas | | Rara |
| Chrysobalanaceae | Coupeia schottii Fritsch | oiti-boi | Vulnerável |
| Leguminosae | Dalbergia nigra (Vell.) Fr. All | jacarandá-da-bahia | Vulnerável |
| Dicksoniaceae | Dicksonia sellowiana (Presl) Hook | samambaiaçu-imperial | Em perigo |
| Lauraceae | Dicypellium caryophyllatum Nees | cravo-do-maranhão, pau-cravo, casca-preciosa | Vulnerável |
| Asclepiadaceae | Ditassa arianeae Font. et Schw | | Em perigo |
| Asclepiadaceae | Ditassa maricaensis Font. et Schw | | Em perigo |
| Moraceae | Dorstenia arifolioa Lam | caapiá, caiapiá, capa-homem, carapiá, contra-erva, figueira-terrestre | Vulnerável |
| Moraceae | Dorstenia cayapia Vell | caapiá, caiapiá, caiapiá-verdadeiro | Em Perigo |
| Moraceae | Dorstenia elata Hook | caiapiá-grande | Rara |
| Moraceae | Dorstenia ficus Vell | contra-erva, figueira-terrestre | Rara |
| Moraceae | Dorstenia fischeri Bureau | caiapiá | Em perigo |
| Moraceae | Dorstenia ramosa (Desv.) Car. et al | caiapiá-grande, capa-homem, contra-erva, figueira-da-terra | Vulnerável |
| Moraceae | Dorstenia tenuis Bompl. ex Bur | violeta-da-montanha, violeta-montes | Vulnerável |
| Bromeliaceae | Dyckia cabrerae Smith et Reitz. | gravatá, bromélia | Em perigo |
| Bromeliaceae | Dyckia distachya Hassler | gravatá, bromélia | Em perigo |
| Bromeliaceae | Dyckia hatschbachii L.B. Smith | gravatá, bromélia | Em perigo |
| Bromeliaceae | Dyckia ibiramansis Reitz | gravatá,bromélia | Em perigo |
| Rutaceae | Euxylophora paraensis Huber | pau-amarelo, pau-cetim | Vulnerável |
| Bromeliaceae | Fernseea itatiae (Wawra) Baker | | Rara |
| Asclepiadaceae | Gonolobus dorothyanus Font. et Schw. | | Em perigo |
| Musaceae | Heliconia angusta Vell | bico-de-guará | Vulnerável |
| Musaceae | Heliconia citrina L. et Em. Santos | | Em perigo |
| Musaceae | Heliconia farinosa Raddi | | Vulnerável |
| Musaceae | Heliconia fluminensis L. Em. et Em Santos | | Vulnerável |
| Musaceae | Heliconia lacletteana L. Em. et Em Santos | | Vulnerável |
| Musaceae | Heliconia sampaioana L. Em | | Vulnerável |
| Balanophoraceae | Helosis cayannensis (Swartz) Sprengel var. cayennensis | sangue-de-dragão | Vulnerável |
| Chrysobalanaceae | Hirtella insignis Briquet et Prance | | Em perigo |
| Chrysobalanaceae | Hirtella parviunguis Prance | | Em perigo |
| Chrysobalanaceae | Hirtella samtosii Prance | | Em perigo |
| Convolvulaceae | Ipomoea carajaensis D. Austin | | Em perigo |
| Convolvulaceae | Ipomoea cavalcantei D. Austin | | Em perigo |
| Theophrastaceae | Jacquinia brasiliensis Mez | barbasco, pimenteira, tingui | Vulnerável |
| Orchidaceae | Laelia fidelensis Pabst | lelia-de-são-fideli | Indeterminada |
| Orchidaceae | Laelia grandis Lindl. et Paxt | lelia-da-bahia | Em perigo |
| Orchidaceae | Laelia jongheana Reinchbach | | Vulnerável |
| Orchidaceae | Laelia lobata (Lindl.) Veitch | lelia-da-gávea | Em perigo |
| Orchidaceae | Laelia perrinii (Lindl.) Paxt | lelia-de-perrin | Em perigo |
| Orchidaceae | Laelia tenebrosa Rolfe | lelia-escura | Em perigo |
| Orchidaceae | Laelia virens Lindl | lelia-verde | Rara |
| Orchidaceae | Laelia xanthina Lindl | lelia-amarela | Em perigo |
| Melastomataceae | Lavoisiera itambana DC | | Rara |
| Chrysobalanaceae | Licania aracaensis Prance | | Rara |
| Chrysobalanaceae | Licania bellingtonii Prance | | Em perigo |
| Chrysobalanaceae | Licania indurata Pilger | milho-cozido | Em perigo |
| Compositae | Lomatozona artemisaefolia Baker | | Rara |
| Compositae | Lychnophora ericoides Mart | arnica, candeia | Vulnerável |
| Leguminosae | Melanoxylon braunia Schott | brauma-preta | Vulnerável |
| Monimiaceae | Mollinedia gilgiana Perkins | | Rara |
| Monimiaceae | Mollinedia glabra Perkins | | Em perigo |
| Monimiaceae | Mollinedia longicuspidata Perkins | | Rara |
| Monimiaceae | Mollinedia stenophylla Perkins | | Em perigo |
| Laureceae | Ocotea basicordatifolia Vattimo | | Rara |
| Laureceae | Ocotea catharinensis Mez | canela-preta | Vulnerável |
| Laureceae | Ocotea cymbarum H.B.K. | óleo-de-nhamuí, inhamuhy, louro-de-inhamuhy, sassafráz | Vulnerável |
| Laureceae | Ocotea langsdorffii Mez | canelinha | Vulnerável |
| Laureceae | Ocotea porosa (Nees) Barroso | imbuia | Vulnerável |
| Laureceae | Ocotea pretiosa Mez. | canela-sassafráz | Em perigo |
| Chrysobalanaceae | Parinari brasiliensis (Schott) Hook | | Em perigo |
| Malvaceae | Pavonia almifolia St. Hil. | guêta | Vulnerável |
| Euphorbiaceae | Phyllantus gladiatus Muell. Arg | dracena-da-praia | Em Perigo |
| Rutaceae | Pilocarpus jaborandi Holmes | jaborandi, jaborandi-de-pernambuco, arruda-do-mato, jaborandi-branco | Em Perigo |
| Rutaceae | Pilocarpus microphyllus Stapf ex Wardl | jaborandi-legítimo, jaborandi-do-maranhão | Em perigo |
| Rutaceae | Pilocarpus trachylophys Holmes | jaborandi-do-ceará, arruda-do-mato | Em perigo |
| Leguminosae | Pithecellobium recemosum Ducke. | angelim-rajado, ingarana | Vulnerável |
| Sapotaceae | Pouteria psammophila var. xestophylla (Miq. et Eichl.) Baehni | | Vulnerável |
| Gentianaceae | Prepusa hookeriana Gardner | cravina-do-campo | Em perigo |
| Anacardiaceae | Schinopsis brasiliensis var. glabra Engl | brauna, baraúna | Vulnerável |
| Simaroubaceae | Simarouba floribunda St. Hil | | |
| Simaroubaceae | Simarouba suaveolensis St. Hill | | |
| Leguminosae | Swartzia glazioviana (Taubert) Glaziou | | Em perigo |
| Meliaceae | Swietenia macrophylla King | mogno, águano, araputangá, caoba, cedroaraná | Em perigo |
| Leguminosae | Torresea acreana Ducke | cerejeira, cumaru-de-cheiro, imburana-de-cheiro | Vulnerável |
| Myristicaceae | Virola surinamensis Warb | ucuuba, ucuuba-cheirosa, ucuuba-branca | Vulnerável |
| Leguminosae | Vouacapoua americana Aubl | acapu | Em perigo |
| Bromeliaceae | Vriesea biguassuensis Reitz | gravatá, monjolinha, bromélia | Indeterminada |
| Bromeliaceae | Vriesea brusquensis Reitz | gravatá, monjola, bromélia | Rara |
| Bromeliaceae | Vriesea mulleri Mez | gravatá | Rara |
| Bromeliaceae | Vriesea pinottii Reitz. | gravatá, monjola, bromélia | Em perigo |
| Bromeliaceae | Vriesea triangularis Reitz | gravatá, monjolinha, bromélia | Indeterminada
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